ساخت و اعتبارسنجی شبکه ارتباط بیولوژیک مابین پروتئین grp۷۸ (پروتئین مرتبط با گلوکز ۷۸ کیلو دالتونی) و فاکتورهای التهابی
نویسندگان
چکیده
روتئین grp78 مارکر مهمی برای استرس شبکه آندوپلاسمی به شمار می رود. مرگ سلولها بواسطه استرس شبکه آندوپلاسمی نقش مهمی در پاتوفیزیولوژی تخریب در بیماریهای مرتبط با تخریب شبکیه بازی می کند. از سوی دیگر، از جمله مارکرهای التهابی دخیل در فرایند پاتوژنز این بیماریها می توان به crp ،cfh ،c3 ، cr1، c5، کاسپاز-4 ، کاسپاز –s 12، mcp، daf، mirlاشاره نمود. هدف از این مطالعه بررسی ارتباط احتمالی بین این دو پدیده یعنی استرس شبکه آندوپلاسمی و التهاب از طریق طراحی شبکه ارتباطی مابین grp78 و فاکتورهای التهابی است. شبکه حاصل از متن کاوی و جستجوی اطلاعات مربوط به میانکنش های پروتئین-پروتئین با داده های بیانی بازیابی شده مربوط به پروتئین های مورد نظر در بافت شبکیه در انسان با استفاده از نرم افزار cytoscape ادغام گردید. ماژول های ساختمانی و عملکردی احتمالی شبکه با استفاده از دو افزونه jactivemodules و clusterone شناسایی شدند. با استفاده از افزونه bingo هریک از ماژولهای شناسایی شده از نظر هر گونه فعالیت زیستی مشترک مورد بررسی قرار گرفتند. از میان ماژولهای شناسایی شده با استفاده از داده های بیانی و مکان شناسی، 9 ماژول حاوی محتوای عملکردی مشترک هستند که به عنوان یک فراگره تعریف شدند. در نهایت شبکه ساده شده ای بدست آمد که روابط مابین grp78 را با فاکتورهای التهابی انتخابی و نیز پروتئین های حدواسط آنها را نمایش می دهد. وجود شبکه پیش بینی شده ارتباطی مابین grp78 به عنوان مارکر کلیدی فرایند استرس شبکه آندوپلاسمی با 10 فاکتور التهابی مطرح در فرایند بیماریزایی بیماریهای مرتبط با تخریب شبکیه کندوکاو شد و بوسیله داده های موجود ترسیم آن امکانپذیر گردید.
منابع مشابه
کلون و بیان پروتئین نو ترکیب 28 کیلو دالتونی غشا خارجی بروسلا ملیتنسیس
زمینه و اهداف: بروسلوز یک بیماری زئونوز بوده و در بسیاری از کشورهای جهان از جمله ایران بعنوان بیماری بومی محسوب می شود. کنترل این بیماری وابسته به پیشگیری از موارد جدید بیماری و تشخیص بیماری می باشد. بررسی آنتی ژن های مختلف و فاکتورهای بیماریزایی سلول بروسلا، در پیشبرد اهداف پیشگیری، تشخیص و ریشه کنی این بیماری دارای اهمیت بالایی می باشد. در این تحقیق، پروتئین نوترکیب 28 کیلودالتونی غشای خارجی...
متن کاملاثر تمرین ورزشی هوازی بر پروتئین سلولی کلارای 16 کیلو دالتونی و کورتیزول افراد وابسته به مواد مخدر
Background: Addiction dependency presents itself as change in the level of protective proteins of airways and increase in stress. The purpose of this study was to determine the effect of aerobic training on Clara Cell protein 16 (CC16) and cortisol in addicts. Methods: In this semi-experimental study, 20 addicted men (20-33 years old) were selected after public call and divided into drug...
متن کاملبررسی اثر پروتئین 100 کیلو دالتونی غضروف کوسه ماهی بر رده سلولی سرطانی K562 و لنفوسیت های خون محیطی طبیعی
سابقه و هدف: غضروف کوسه یکی از مکمل های دارویی در حذف تومور بیماران سرطانی است. البته در مورد اثر فراکشن 100 کیلو دالتونی آن بر سیستم ایمنی گزارشی اعلام نگردیده است. هدف این مطالعه، بررسی تاثیر این فراکشن بر رده سلولی سرطانی K562 و لنفوسیت های خون محیطی طبیعی انسان می باشد.روش بررسی: در این تحقیق تجربی، جهت تخلیص پروتئین 100 کیلو دالتونی غضروف کوسه ماهی از روش تخلیص کروماتوگرافی ژل فیلتراسیون ا...
متن کاملتعیین میـزان ایمنی‌زایـی واکسن ژنی دو گــانه حـامل ژن‌هـای پروتئین متصل شونده به پریپلاسم و پروتئین 31 کیلو دالتونی لایه خارجی بروسلا ملیتنسیس در موش‌های بالب ـ سی
تعیین میـزان ایمنی‌زایـی واکسن ژنی دو گــانه حـامل ژن‌هـای پروتئین متصل شونده به پریپلاسم و پروتئین 31 کیلو دالتونی لایه خارجی بروسلا ملیتنسیس در موش‌های بالب ـ سی مقدمه و هدف: بروسلا یک باکتری داخل سلولی اختیاری است که عامل بیماری بروسلوز بوده و می‌تواند در انسان و دام‌ها ایجاد عفونت نماید. سویه‌های تضعیف شده این باکتری نظیر بروسلا ملیتنسیس سویه Rev1 و بروسلا آبورتوس سویه‌های S19 و Rb51 هم ا...
متن کاملمقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure
کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
genetics in the 3rd millenniumجلد ۱۲، شماره ۴، صفحات ۳۷۴۴-۳۷۵۳
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023